NuMeCan, acteur clé du projet JEMINI pour décrypter les liens entre microbiote intestinal, nutrition et maladies métaboliques - Carnot AgriFood Transition

Ce projet d’envergure, financé à hauteur de 6,6 M€ sur cinq ans, vise à mieux comprendre les interactions entre le microbiote de l’intestin proximal, les habitudes alimentaires, le mode de vie et les mécanismes immunométaboliques impliqués dans les pathologies chroniques liées à l’alimentation.

Un projet ambitieux centré sur la partie haute de l’intestin

Coordonné par la Pr Karine Clément, professeure de nutrition à l’APHP et directrice de l’unité Inserm-Sorbonne Université NutriOmics, JEMINI rassemble un consortium multidisciplinaire de neuf partenaires académiques et hospitaliers : Sorbonne Université, Université Claude Bernard Lyon 1, Inserm, INRAE (dont NuMeCan), IRD, Institut Pasteur, ainsi que les centres hospitaliers universitaires de la Pitié-Salpêtrière (APHP) et des Hospices civils de Lyon.

Contrairement à la majorité des études actuelles qui se concentrent sur le microbiote fécal, JEMINI s’intéresse au microbiote duodéno-jéjunal, soit la partie « haute » de l’intestin, encore peu explorée. Ce site apparaît pourtant comme un acteur clé du dialogue entre alimentation, microbiote et santé métabolique.

Le projet vise à corréler les profils bactériens du duodénum et du jéjunum avec le statut métabolique de patients souffrant de maladies liées à l’alimentation, comme le diabète ou l’obésité. Une intervention nutritionnelle basée sur un régime méditerranéen personnalisé permettra d’évaluer l’effet de l’alimentation sur la composition microbienne, avec deux phases de prélèvements par endoscopie à l’inclusion et après deux mois de régime.

NuMeCan, référent du modèle porcin au service de la transposition préclinique

Responsable de la tâche dédiée au modèle animal, Gaëlle Boudry (équipe EAT – NuMeCan) coordonne un important volet expérimental reposant sur 50 porcs, sélectionnés pour leur proximité physiologique avec l’Homme, notamment en termes de régime omnivore et de physiologie digestive.

NuMeCan reproduira le protocole humain chez le porc, en induisant d’abord une obésité contrôlée, suivie de la mise en œuvre de régimes alimentaires différenciés (incluant ou non des additifs). Des prélèvements endoscopiques et des biopsies seront réalisés tout au long du protocole, en parallèle de prises de sang, mesures comportementales et enregistrements alimentaires via des dispositifs instrumentés.

L’approche porcine permettra des investigations approfondies sur les relations entre microbiote jéjunal, épithélium intestinal et statut métabolique, apportant des données inaccessibles chez l’Homme.

Perspectives d’innovation pour les filières agroalimentaires

Au-delà des avancées scientifiques attendues, le projet JEMINI ouvre des perspectives concrètes pour l’innovation agroalimentaire :

• Identification d’ingrédients nutritionnels à fort impact métabolique, notamment issus du régime méditerranéen.
• Détection et isolement de souches bactériennes potentiellement utilisables comme nouveaux probiotiques.
• Constitution d’une souchothèque pour une valorisation future en recherche partenariale.

Grâce à son expertise sur le microbiote, la nutrition et le modèle porcin, NuMeCan confirme son rôle stratégique au sein de l'institut Carnot AgriFood Transition pour accompagner les entreprises des filières agricoles et agroalimentaires dans leurs projets de R&D et d’innovation en nutrition humaine. 
 

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